Žrijebanje parova šesnaestine finala Kupa Bosne i Hercegovine 2024/25 bit će održano u utorak, 08. oktobra, u 12 sati u prostorijama NSBiH u Sarajevu.
U ovoj fazi takmičenja će učestvovati sljedeći klubovi:
FK BORAC Banja Luka, NK BRATSTVO Gračanica, NK ČELIK Zenica, FK FAMOS Hrasnica, FK FAMOS Istočna Ilidža, FK GORNJI RAHIĆ Gornji Rahić, NK GOŠK Gabela, FK IGMAN Konjic, FK KOZARA Gradiška, HNK KRUŠEVO Kruševo, FK LAKTAŠI Laktaši, FK LEOTAR Trebinje, FK MLADOST Solina, HŠK POSUŠJE Posušje, FK RADNIK Bijeljina, FK RUDAR PRIJEDOR Prijedor, FK SARAJEVO Sarajevo, FK SLAVIJA Istočno Sarajevo, FK SLOBODA Novi Grad, FK SLOBODA Tuzla, FK SLOGA DOBOJ Doboj, NK STUPČANICA Olovo, NK SVATOVAC Poljice, NK ŠIROKI BRIJEG Široki Brijeg, NK TROGLAV 1918 Livno, NK VAREŠ Vareš, FK VELEŽ Mostar, HŠK ZRINJSKI Mostar, NK ZVIJEZDA Gradačac, FK ZVIJEZDA 09 Bijeljina, FK ŽELJEZNIČAR Sarajevo, NK ŽEPČE 1919 Žepče.