Žrijebanje parova šesnaestine finala Kupa Bosne i Hercegovine 2025/26 bit će održano u utorak, 7. oktobra u 12 sati u prostorijama Nogometnog saveza BiH u Sarajevu.
U ovoj fazi takmičenja će učestvovati sljedeći klubovi:
FK BORAC Banja Luka, FK BSK Banja Luka, FK CRNI VRH Jaružani, NK ČELIK Zenica, FK FAMOS Hrasnica, NK GOŠK Gabela, OFK GRADINA Srebrenik, HNK GRUDE Grude, HNK KRUŠEVO Kruševo, NK JEDINSTVO Bihać, FK LAKTAŠI Laktaši, FK LEOTAR Trebinje, FK MAJEVICA Lopare, ŠD NAPREDAK Matići, HŠK POSUŠJE Posušje, FK RADNIK Bijeljina, FK RADNIK Hadžići, FK ROMANIJA Pale, FK RUDAR PRIJEDOR Prijedor, FK SARAJEVO, FK SLAVIJA Istočno Sarajevo, FK SLOBODA Tuzla, FK TEKSTILAC Derventa, NK SLATINA Bašigovci, FK SLOGA DOBOJ Doboj, NK STUPČANICA Olovo, NK ŠIROKI BRIJEG Široki Brijeg, FK TUZLA CITY Tuzla, FK VELEŽ Mostar, HŠK ZRINJSKI Mostar, FK ZVIJEZDA 09 Bijeljina, FK ŽELJEZNIČAR Sarajevo.